Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TIMM17BO60830 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TIMM17BO60830 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms