Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDE8AO60658 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE8AO60658 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms