Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRC1O43663 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRC1O43663 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRC1O43663 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRC1O43663 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRC1O43663 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRC1O43663 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRC1O43663 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms