Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIN2DO15399 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIN2DO15399 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms