Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
VGFO15240 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VGFO15240 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VGFO15240 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VGFO15240 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VGFO15240 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VGFO15240 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VGFO15240 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VGFO15240 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VGFO15240 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
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