Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms