Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms