Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR3AO14802 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms