Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F3O00716 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F3O00716 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2F3O00716 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms