Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms