Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L13C9JLJ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L13C9JLJ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms