Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PATL2C9JE40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms