Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms