Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SOBPA7XYQ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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