Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PCNX2A6NKB5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCNX2A6NKB5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms