Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCE3A1L190 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE3A1L190 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms