Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TCRBV5S1A1TA0A578 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S1A1TA0A578 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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TCRBV5S1A1TA0A578 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TCRBV5S1A1TA0A578 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TCRBV5S1A1TA0A578 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TCRBV5S1A1TA0A578 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TCRBV5S1A1TA0A578 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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