Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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