Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDY1Q9Y6F8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDY1Q9Y6F8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms