Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SNX13Q9Y5W8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SNX13Q9Y5W8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX13Q9Y5W8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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