Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES2Q9Y543 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES2Q9Y543 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms