Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFG3L2Q9Y4W6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2Q9Y4W6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms