Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9Y3F1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms