Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMED5Q9Y3A6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED5Q9Y3A6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms