Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX2Q9Y2T7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms