Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HHLA3Q9XRX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms