Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHF8Q9UPP1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHF8Q9UPP1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHF8Q9UPP1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms