Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF2Q9UNY4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms