Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ZNF608Q9ULD9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
ZNF608Q9ULD9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ZNF608Q9ULD9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms