Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms