Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SCP2D1Q9UJQ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCP2D1Q9UJQ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms