Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMPXQ9UHP9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms