Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2IRD1Q9UHL9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms