Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNTNAP2Q9UHC6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP2Q9UHC6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms