Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SWAP70Q9UH65 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SWAP70Q9UH65 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWAP70Q9UH65 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms