Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIP2Q9UDT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIP2Q9UDT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms