Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUX4Q9UBX2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms