Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC6Q9UBN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC6Q9UBN7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms