Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG4Q9UBN1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms