Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPARGC1AQ9UBK2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPARGC1AQ9UBK2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms