Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP28Q9P2N2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms