Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP35Q9P2H5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP35Q9P2H5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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