Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
CCDC180Q9P1Z9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CCDC180Q9P1Z9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms