Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBP1Q9NZI7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBP1Q9NZI7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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