Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA2D2Q9NY47 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D2Q9NY47 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms