Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms