Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC28Q9NX36 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms