Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT57Q9NWB7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT57Q9NWB7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms