Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO28Q9NVF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO28Q9NVF7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms