Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC39A9Q9NUM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC39A9Q9NUM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms